第四百章 動態APT(1 / 4)

        龐學林淡淡一笑,他倒沒有阿什福德那般失望,這份檢測報告的出爐,反而讓他下定決心確定了接下來的研究方向。

        龐學林出聲道:“我個人檢測報告的事先放一邊吧,接下來我們最主要是做好兩方面的工作。第一,我們必須搞清處艾麗絲體內的T病毒為什么會轉變為ERV序列,找出這中間生物化學上的原理,我會說服艾麗絲配合你們的研究工作。至于另一個方向,就是對非編碼RNA的研究……”

        “非編碼RNA?”

        斯普魯斯等人一臉驚訝。

        非轉錄RNA涉及到如何控制T病毒的問題,這半年來實驗室主要研究T病毒如何加速人體細胞的代謝速度以及一系列生化反應機理的問題,并沒有在如何抑制T病毒方面有所作為。

        龐學林也沒告訴眾人非編碼RNA的事。

        龐學林微笑道:“對于T病毒的研究,我們除了搞清楚它侵入人體的途徑并且產生的一系列危害外,我們也需要找到抑制這種病毒的辦法。大家都應該知道RNA干擾導致的基因沉默現象,從某種意義上說,基因沉默現象很可能是生物體進化過程中用來抵御轉座子或者RNA病毒的一種防御機制,是生物體使用的一種古老的抗病毒策略,我覺得想要抑制T病毒,甚至消滅T病毒,我們可以考慮從這方面入手。而RNA干擾又與非編碼RNA有著密不可分的聯系,所以我們未來一段時間內,主要工作就是盡可能找出人體內的非編碼RNA彼此之間以及與蛋白質之間的相互作用,我們分別以健康人、喪尸、艾麗絲以及我自己的健康細胞作為研究對象。”

        斯普魯斯和柏克萊對視了一眼,柏克萊沉吟片刻,點頭道:“這個想法很好。不過這里面存在很大的問題。”

        “什么問題?”

        龐學林有些好奇道。

        柏克萊道:“想要研究非編碼RNA在細胞內與其他非編碼RNA以及蛋白質之間的相互作用,我們就必須對蛋白質有一個非常深入的認知。特別是蛋白質的動態性與其內在功能的聯系,必以我們目前實驗室內的儀器,恐怕很那做到。”

        “就拿蛋白質來說,雖然自二十世紀中期,血紅蛋白的晶體結構被解析以來,我們已經知道了很多蛋白質及其復合物的空間結構,。特別是近年來,隨著結構解析方法學的發展,特別是結構基因組學的興起,我們可以通過晶體衍射、核磁共振、冷凍電鏡等手段,大幅度加快了解析蛋白質的三維結構速度。”

        “但是迄今為止,我們依然無法從蛋白質的一級序列去推斷它的三維結構,更不能準確預測它的生物學功能,甚至在已知三維條件下也很難做到準確地認識蛋白質的功能。原因很簡單,我們缺少對蛋白質時間維度的了解。蛋白質是具有一定空間結構的實體,其三維性質,如我們所熟知的疏水袋、套裝環等,與它的生物功能緊密相關。”

        “然而,在溶液中,蛋白質處于不斷地運動和變化狀態,在活細胞內,蛋白質又要經過折疊、修飾、轉運和組裝成復合物的過程。這種運動的時間尺度隨不同蛋白質、同一蛋白質在不同環境、同一蛋白質的不同部位各不一樣。例如,通常酶的活性部位的運動性比較大,而二級結構部位則較為剛性。因此,同蛋白質的三維結構一樣,蛋白質的動態學特征在決定蛋白質功能的過程中具有同等重要的作用。”

        “因此,我們必須具備在原子水平上實時觀察蛋白質動態變化的能力,然而由于結構研究方法的局限性,我們目前只能拍到蛋白質在某個瞬間的圖景。然而事實上,溶液中的蛋白質并不像晶體結構中所描述的那樣,只具備一個靜態結構,而是包含了一個動態的過程。從物理學的觀念上看,蛋白質在熱運動的作用下,在平衡結構附近存在著一個巨大的構象組合,就是構象簇。正是這種構

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