從日本回來不久，張之洞另交給他一項任務，到湖北槍炮廠負責監制快炮。他努力把在日本所學，用在監制快炮的實踐中。他在監制中，非但沒像某些人那樣，利用這特有資源的監督權耍威風，出難題，而是在嚴格把關的同時，盡自己所能，幫助解決生產中技術問題，深得廠方好評。

一八九九年十二月，張之洞第二次派黎元洪去外國考察，重點是考察馬隊和步隊的教育、訓練和軍紀等方面的情況，計劃用一年時間。但第二年春夏之交，北方爆發了義和團運動。當慈禧受清廷內的極.端.分.子影響，對十多個列強宣戰時，張之洞跟隨李鴻章等人參與東南互保。因為內外壓力，張之洞覺得可信任的人手不夠，就急電黎元洪回國。

一九零零年六月，黎元洪奉招回到武漢，他如實地向張之洞匯報了在日本考察學習的情況。

因為黎元洪二次赴日，考察的主要專業都是騎兵，成了騎兵方面的專攻，黎元洪這次被派到護軍馬隊第一營任管帶。

參加東南互保，是秘密進行的，張之洞是個十分謹慎的人。做一些機密之事，他是不敢交給別人的。黎元洪則是他可以絕對信任的人，不管事情有多大的風險，他都敢放心交給黎元洪去辦。而黎元洪每一次，都沒有辜負張之洞對他的信任。

黎元洪第三次赴日本考察是在一九零一年秋，清廷經歷了庚子事變的打擊，開始實行新政。數量不小的軍隊，經不住人數有限的八國聯軍的打擊，清廷上下，在實行新政時，尤其熱衷于“籌款練兵”。一貫致力于練新軍的張之洞受到了推崇，黎元洪跟著張之洞也就有了更大的舞臺。

正當黎元洪全力協同張之洞練新軍時，同年九月，張之洞得到了日本在仙臺舉行陸軍操練的消息。他認為機會難得，就派出自己的得力干將黎元洪前往。陪同黎元洪前去觀練的，還有張之洞最為疼愛，被寄以厚望長孫張厚琨。這是一次有一定規格的活動，黎元洪在活動中，被邀為陪覽官。活動結束后，被主辦方授予“雙光耀日”紀念章一枚。

在觀摩中，黎元洪眼見日本軍隊超凡的素質，和高水平的發揮，大開了眼界，也大受啟發。這一次他有了一個新的感悟，要想使自己的國家強大起來，最終是要靠實力說話；平日里的抱怨和說激昂話是沒有什么實際意義的。

其后，黎元洪在日本作了一番走馬觀花的參觀和訪問，使他更加長了見識。他看到了日本的國力和國情，認識到了日本不光是軍事上強大，社會方方面面都走在了自己國家的前面，他把這里發生的很多事都和國內進行比對，覺得差距是多方面的。

三次對日本的考察，使黎元洪的眼界大開，對黎元洪的一生都產生重要影響。不僅學到了現代軍事知識，也對近代的社會學說，如天賦人權、三權獨立，民約論，進化論等學說，對民主共和的思想，也都有了一定的了解。

武昌首義后，有人回想起黎元洪對革命黨人活動的默許和寛容，覺得不能單純的歸結到黎元洪的為人方面，認為他在很多方面，是贊同革命黨的。只是，限于他的身份，他不能過度的表現而已。還有就是，他堅定的共和主張，也肯定不是頭腦一熱的結果。

一九零四年秋，清廷練兵處襄辦大臣鐵良到各省巡視練兵情況。

翌年春，鐵良一行到湖北，匯報演習在武昌城外的巡司河、梅家山一帶進行。演習部隊分成甲、乙二方，甲攻而乙守。

作戰號角響起，甲方開始進攻。

那一年是倒春寒，演習的那一天正碰上武昌少見風雪交加天。冒著風雪和刺骨的寒風，甲方在指揮官帶領下，沖鋒陷陣，迂回三十余里，一絲不茍，視演習如實戰。乙方也不示弱，筑起掩體，固守陣地。甲乙雙方在風雪中相持，難分勝負。

鐵良觀摩完后，感慨萬分，言道：“余閱沿江、沿海各省軍隊