駐守西安府城的漢軍明智的選擇了投降，少量滿八旗和蒙八旗的軍士，被漢軍全部斬殺，或許到了這個(gè)時(shí)候，漢軍軍士郁悶的氣息才徹底爆發(fā)出來(lái)，從京城出發(fā)的一萬(wàn)漢軍，潼關(guān)之戰(zhàn)被硬逼著進(jìn)攻，幾乎損失殆盡，若不是依靠部分的漢軍軍士操控紅夷大炮，恐怕一個(gè)漢軍軍士都不要想著活下來(lái)。

這一戰(zhàn)朝廷大軍收獲太豐盛，繳獲的黃金白銀超過四千萬(wàn)兩，糧食四萬(wàn)多石，還有十多門紅夷大炮，以及數(shù)量不菲的虎蹲炮、弗朗機(jī)等等。

黃金白銀以及糧草，絕大部分都是李自成通過追餉令獲取的，如今全部歸于朝廷。

留守西安府城的孔友德、耿仲明和尚可喜三人全部被活捉，因?yàn)榭词貪h軍軍士的疏忽，孔友德在營(yíng)房里面自盡身亡，新任陜西總兵黃得功請(qǐng)示朱慈烺之后，毫不留情的斬殺了耿仲明和尚可喜兩人。

如何處置被看押的近三萬(wàn)原大順軍軍士，令黃得功頭疼，這些投降的軍士，早就被殺戮嚇破了膽，進(jìn)入軍中是不可能了，如果安置到地方上去，又需要有人看守，免得有些蠢蠢欲動(dòng)之人從中作亂，還是朱慈烺一句話提醒了黃得功，這些大順軍的軍士，不久之前還是流民和百姓，讓他們回到地方去耕種土地，沒有多大的麻煩。

黃得功沒有多少學(xué)識(shí)，亦不會(huì)處理地方上的政務(wù)，也不耐煩做這些事，處置陜西各地事宜暫時(shí)以內(nèi)閣大臣、兵部尚書史可法為主，因?yàn)樾枰幹玫氖虑轭H多，朱慈烺在西安府城停留了三天的時(shí)間。

陜西一地，嚴(yán)重缺乏地方官員，特別是地方的主官，史可法建議從南方各地抽調(diào)官吏進(jìn)入陜西，擔(dān)任府州縣的主官，朱慈烺沒有采納這個(gè)建議，開年之后就是會(huì)試，朱慈烺內(nèi)心已經(jīng)有了定奪，在使用官員這件事情上面，他要擬出來(lái)全新的條陳，要對(duì)全國(guó)的各級(jí)主官進(jìn)行全面的考核，徹底清理那些占著茅坑不拉屎的蠹蟲。

朱慈烺親筆寫下詔書，要求大同總兵姜驤前往西安府城，原徐州總兵胡華山出任大同總兵，至于說(shuō)姜驤如何安排，朱慈烺還沒有考慮。

大同一地位置太過于關(guān)鍵，務(wù)必派遣得力之人駐守，至于說(shuō)南直隸各地，不需要設(shè)立那么多的總兵，譬如說(shuō)廬州、徐州和鳳陽(yáng)等地，不管是總督還是總兵，都要撤銷。

大戰(zhàn)之后剩下的十二萬(wàn)多軍士，楊文聰率領(lǐng)其中兩萬(wàn)人，已經(jīng)趕往山東德州，黃得功麾下近三萬(wàn)人全部留在陜西，胡華山率領(lǐng)兩萬(wàn)人趕赴大同，其余軍士跟隨河南總兵孫明凱暫時(shí)返回河南，過了潼關(guān)之后，將交于四川總督馬士英指揮，進(jìn)入四川徹底剿滅張獻(xiàn)忠。

史可法提出了建議，等候在湖廣鄖陽(yáng)的鄧世秋，麾下有五萬(wàn)軍士，馬士英若是率領(lǐng)十萬(wàn)大軍近川，總兵力達(dá)到了十五萬(wàn)人，剿滅張獻(xiàn)忠不需要如此之多的兵力，再說(shuō)了，多爾袞若是真的領(lǐng)兵進(jìn)攻山東德州，黃得功與胡華山率領(lǐng)的兵力進(jìn)逼京城，看上去有些單薄，還是應(yīng)該留下一部分兵力駐守河南，這樣陜西與河南兩地都能夠迅速穩(wěn)定下來(lái)。

朱慈烺略微考慮之后，同意了史可法的提議，改由馬士英率領(lǐng)參加了馬欄山之戰(zhàn)的五萬(wàn)精銳軍士進(jìn)入四川，與鄧世秋率領(lǐng)的五萬(wàn)大軍合兵一處，剿滅張獻(xiàn)忠，穩(wěn)定四川的局勢(shì)。

征伐八旗軍的明軍還剩下五萬(wàn)人，按照史可法的提議，其中兩萬(wàn)人留在河南，歸于河南總兵孫明凱指揮，兩萬(wàn)人暫時(shí)留在西安府城，準(zhǔn)備進(jìn)駐北直隸和京城，其余一萬(wàn)余人跟隨皇上前往南京。

作戰(zhàn)繳獲的糧食全部留下，陜西與河南兩省各自分配兩萬(wàn)石，繳獲的黃金白銀，陜西與河南兩省各自留下五百萬(wàn)兩，其余全部押解到南京去，扣除需要撫恤和賞賜的部分，還可以省下一千五百萬(wàn)兩白銀，戶部的日子能夠好過很多了。

因?yàn)楸Φ恼{(diào)動(dòng)，馬士英率領(lǐng)等候的五萬(wàn)軍士之中的三萬(wàn)人經(jīng)過潼關(guān)，抵達(dá)西安府城，其余兩萬(wàn)軍士原地等候，將要跟隨河南