當得知聯軍開始進軍洛陽時，董卓就趕緊調派華雄前去虎牢關，同時他自己也意識到恐怕洛陽是守不住了，因此聽從了李儒的計策——遷都長安。

東漢自光武帝劉秀定都洛陽，歷經百年經營，宮殿苑囿、官寺府庫，洛陽凝結了幾代人的智慧與汗水，作為帝都，洛陽早已為天下共知，這里匯聚了四方財富，人文薈萃，公卿貴戚室邸相望，洛陽的繁華與富庶，令天下神往！

洛陽乃首善之區，但是對于董卓來說不但此時關東諸侯組成聯軍虎視眈眈，在北方還有黃巾余部白波軍作亂，雖然黃巾軍實力不足以威脅到董卓，可是他們所出的位置正好是在洛陽與西涼之間的必經之路上，若是稍有不慎，董卓就將陷入前后夾擊沒有退路的危險境地。

董卓要遷都的消息不脛而走，公卿百官的家都在洛陽，誰想走？誰又愿意走！長安早已廢棄多年，根本無法與繁華的洛陽相比。

董卓也知道百官不愿遷都，但此事他主意已定，遷是必須的，不過他也知道因為廢立皇帝之事，士大夫們對他恨之入骨，因此遷都的事情他不愿親自出面，便上表漢獻帝，請求任命河南尹朱儁做太仆也就是他秘書。

使臣帶著冊書來見朱儁，朱儁卻說什么也不肯拜受，使者看朱儁不受詔，自己無法交差，也不走了。朱儁干脆明說，西遷長安必令天下騷動，我不能受詔。結果朱儁硬是頂住壓力，沒有接受任命。

董卓的意思是讓朱儁代替自己領銜主持遷都之事，朱儁也不傻，堅決不背這個黑鍋，不上董卓的賊船。

沒有辦法董卓最后還是只好親自上陣，召集文武百官開會。會上，董卓首先發言，大談遷都應合石包讖，必將有利國家。

百官聞聽盡皆嘩然，三公之一的司徒楊彪率先發言了“遷都改制，關乎天下安危，應謹慎從事。殷商盤庚遷都，引發民眾不滿，昔日關中被赤眉焚毀，已是一片廢墟，本朝自光武帝定都洛陽已有百年，百姓世代居此，安居樂業，現在突然讓他們背井離鄉，恐百姓騷動，更加之宗廟社稷都在此。遷都，一切均需重建，耗費巨大，國庫空虛，恐難承受。石包讖乃妖妄之書，決不可信，還請相國三思。”

董卓見楊彪公然跟自己唱反調很不痛快，但楊彪德高望重在朝中很有威信，楊家也是四世三公的世家名門，論門第不在袁家之下，董卓還是給了楊彪幾分面子，沒有當場發作。

董卓很有耐心地對楊彪提出的困難逐一反駁，楊彪也據理力爭，董卓頓時有些急了，就要發怒殺人。

太尉黃琬看風頭不對，趕忙過來打圓場“遷都事關重大，楊公也是為國家著想，他的話不無道理。”董卓拉著臉也不答話，一時間，大殿上場面尷尬。

三公之一的司空荀爽見今天這個形勢，知道說什么都沒用，董卓主意已定，再多說，只能激怒董卓惹禍上身，趕緊出列和稀泥道“遷都也是迫于無奈，乃不得已而為之，若不是關東叛亂，相國難道愿意遷都嗎？相國考慮的是，關東叛亂非一日可定，遷都乃平叛需要，相國是效法當年高祖據關中以安天下。”

荀爽的一番話讓董卓稍微舒服了一些，這才勉強擠出些許笑容，宣布退朝。太尉黃琬回家后連夜寫表章，將遷都的弊端一一列出，希望董卓能回心轉意。

董相國并未批復，他用實際行動做了回答。幾天后，董卓用各地連續有災害做借口，免去了楊彪、黃琬等人的職務。在漢朝天災頻繁發生，作為三公都是具有責任的，這也是皇帝或者權臣為了鏟除異己的手段。

同時為了安撫士大夫們，又提拔了比較傾向于他的一些官員，其中就有王允接替楊彪擔任了司徒一職。

又過了幾天，董卓又氣惱袁紹當選聯盟盟主帶頭討伐自己，遷怒整個袁氏一家，自袁紹叔父太傅袁隗以下，屠盡所有