科都給事中李獻可，等人違旨欺君，將李獻可貶去一級，降為〈禮科左給事中〉調去外地，其余的官員一律奪俸半年。

但是圣旨下達之后明內閣首輔王家屏，以為明禮科左給事中李獻可，等人所言甚切，所以拒不奉詔執行，并將明神宗朱批封還，致使明神宗大罵王閣老，無人臣之禮！

此時明吏科都給事中鍾羽正，上奏稱“禮科左給事中李大人之疏，臣實贊同，愿與李大人一同治罪。”

隨后明吏科給事中舒弘緒，就上奏道“言官可治罪，但預教必不可不行。”

這讓明神宗更加生氣，遂將明吏科給事中調往南方，明吏科都給事中與明禮科左給事中則一并以雜職發配邊疆。

再遇到明東閣大學士趙志皋，上疏論救，又遭皇帝陛下斥責。

接著都察院左右御史、六科給事中，等多人紛紛抗疏諫爭，均遭懲處，朝堂驚駭，明神宗直接將明禮科左給事中李獻可，為主的上奏之人革職除名，永不敘用。

2月10日，明寧夏衛總鎮副總兵哱拜，因被人（明榆林衛兵備道副使張繼芳）舉報吃空餉？而受到了明寧夏總鎮巡撫黨馨，的裁抑，其實吃空餉是小事，企圖招攬兵馬是大事，有造反的前奏。

長子明寧夏衛指揮同知哱承恩，也因強占民女為妾，而受到明寧夏總鎮巡撫下令鞭打他二十下以示告誡。

就連明靈州守御千戶哱云、明寧夏衛指揮使土文秀，也因為其他原因而怨恨明寧夏總鎮巡撫。

恰好戍卒請求衣服、糧食，很久都沒有收到，故此明寧夏衛總鎮副總兵哱拜，就唆使明寧夏衛總鎮左參將劉東旸、明寧夏衛總鎮右參將許朝，犯上作亂。

于2月18日辰時，糾集部眾發動反叛，殺死明寧夏總鎮巡撫黨馨、明榆林衛兵備道副使石繼芳，放火焚燒寧夏衛指揮所公署、劫奪符印、開庫發銀、釋放囚犯、搶掠居民，還殺死明寧夏衛游擊將軍梁琦、明寧夏衛守備馬承先。

又強迫明寧夏衛總鎮總兵張維忠，交出敕印，逼他自縊而死！

隨后明寧夏衛總鎮左參將劉東旸，自稱為「寧夏衛總鎮總兵」奉明寧夏衛總鎮副總兵哱拜，為謀主，明寧夏衛指揮同知哱承恩，為「寧夏衛總鎮左副總兵」、明寧夏衛總鎮右參將許朝，為「寧夏衛總鎮右副總兵」、明靈州守御千戶哱云，為「寧夏衛總鎮左參將」、明寧夏衛指揮使土文秀，為「寧夏衛總鎮右參將」。

于是叛將寧夏衛總鎮左參將哱云，率軍攻陷了寧夏衛、寧夏前衛、寧夏左屯衛、寧夏右屯衛、寧夏中屯衛、寧夏中衛，使得其余黃河以西地帶城堡望風而降。

叛將寧夏衛總鎮右參將土文秀，則進攻寧夏平虜守御千戶所、興武營守御千戶所、韋州群牧千戶所，僅有明寧夏后衛指揮使蕭如薰，堅守城池拒不投降。

如今叛賊已經奪取了黃河以西四十七座城堡，而且渡過了黃河，準備聯合河套右翼多羅土蠻部首領孛兒只斤·著力兔歹成臺吉、河套右翼多羅土蠻部太師宰僧，進犯寧夏平虜守御千戶所、寧夏后衛，等地。

就連原本入朵甘都指揮使司的漠南蒙古多羅土蠻部首領孛兒只斤·火落赤，以及漠南蒙古土默特部兼大明順義郡王孛兒只斤·扯力克，也一起發兵入陜西行都指揮使司來助寧夏王哱拜，叛亂導致陜西承宣布政使司全境震動。

3月初4日，明陜西三邊總督魏學曾，下令明固原衛總鎮副總兵李昫，率領明平虜守御千戶所游擊將軍吳顯，趕赴寧夏衛靈州守御千戶所平叛。

在派遣了明鎮戎守御千戶所游擊將軍趙武，趕赴寧夏中衛鳴沙州，沿著黃河一帶阻止叛賊南渡，自己則進駐在寧夏后衛花馬池堡，充當叛賊的沖要。

3月初8日，明陜西三邊總督魏學曾，立刻向朝廷報告明寧夏衛總鎮副總兵哱拜，反叛之事。

明神宗聽后即