之后豐臣秀吉病死幕府倭軍大亂，而倭軍第二隊加藤清正，迅速撤兵回國，接著朝鮮全羅道左水使李舜臣、明武靖營參將鄧子龍，在〖露梁海戰〗中抗擊倭軍犧牲（萬歷朝鮮戰役結束）。

而南方明四川巡撫譚希思，在綦江、合江設防攔截楊應龍叛軍，同時又是佟努爾哈赤第五次來京城朝貢大明天子，以麻痹朝廷與遼東都司的懷疑方便繼續攻打其余女真部落。

明萬歷二十七年公元1599年佟努爾哈赤以背盟為由滅掉哈達女真部擒殺哈達貝勒納拉·猛骨孛羅，并采用蒙文為建州女真語配上字母，由于海西女真各部的衰弱！佟努爾哈赤還主動發兵進攻東海女真渥集部。

同時楊應龍搗毀了重慶府和城嘟府并抓住明蜀恭親王朱奉銓，來威脅明軍說道“我只是為了擴張地盤，希望爾等回去轉告朝廷能夠再次赦免我。”