改為洪述祖，并入余聯(lián)沅之幕府。

光緒二十八年（1902年）秋，清廷重新起用洪述祖，以候選知縣分發(fā)湖北。在漢口任職兩年多，歷任漢口清丈局坐辦、漢口厘局交涉文案兼辦鄂中洋務(wù)交涉、漢陽府夏口廳發(fā)審委員、漢口警察第二局總辦等職。

光緒三十一年（1905年）春因與江漢關(guān)道繼昌不和，洪述祖辭職，重返上海，協(xié)助李經(jīng)方辦理安徽鐵路事宜。

光緒三十三年（1907年）被選拔到直隸任職，歷任全省水利總局會辦、洋務(wù)局會辦、印花稅局會辦、度量權(quán)衡局會辦等多個差使。一年試用期滿后，直隸總督楊士驤給他的評語是“精明干練，頗知大體，堪為優(yōu)等”，奏請留省補用。民國風(fēng)云人物演義