這個時候朝廷才知道經(jīng)略、巡撫兩人不和！心想；定會壞了邊疆大事！群臣們奏章紛紛討論此事，明南直隸兵部尚書就勸明遼東巡撫除掉明遼東經(jīng)略。

此時南方永寧宣撫使奢崇明，自稱「大梁王」發(fā)兵包圍城嘟府而城內(nèi)只有鎮(zhèn)遠營明軍7百人，明蜀景親王朱志澎，急令明四川布政使朱燮元，力抗擊又調(diào)石柱宣慰司和龍安府等地軍隊抵抗，得到明熹宗夸獎升朱夑元為四川巡撫，并調(diào)明山東按察司僉事楊愈茂，為四川總兵率明軍出征。

同時明一品誥命夫人親率川軍白桿兵4千人進駐南坪關，明貴州巡撫李標，則派明銅仁府總兵張彥芳、明貴州總兵許成名、明貴州都指揮使黃運清，等援救四川承宣布政司從10月至12月之間，打了大小百余戰(zhàn)才消滅土司兵1萬3千人，先后收復了遵義府、綏陽縣、湄潭縣、桐梓縣、烏江縣等地。

另外叛軍大梁王奢崇明，之子奢寅，在城嘟府造云梯和呂公車日夜攻城，明一品誥命夫人等各路明軍到達城嘟府后，與明登萊副使楊述程、明安錦副使劉芬謙，打敗叛軍于牛頭鎮(zhèn)又收復了新都縣。

明天啟二年公元1622年明刑部員外郎徐大化，配合明遼東巡撫彈劾明遼東經(jīng)略，并把奏章發(fā)給各部被明熹宗拒絕，正好遇后金軍逼近西平堡，朝廷才停止了爭議命他們共同抗金而西平堡被圍！明遼東巡撫聽信了明廣寧衛(wèi)中軍游擊孫得功，的計策發(fā)動了廣寧衛(wèi)部兵力讓明廣寧衛(wèi)中軍游擊和明靖東營中軍游擊祖大壽、明甘肅總兵會合前去作戰(zhàn)。

明遼東經(jīng)略也令明盤山參將劉渠，拔營支援但在平陽橋遭遇后金軍，剛一交鋒明廣寧衛(wèi)中軍游擊和明廣寧前屯衛(wèi)參將鮑承，首先逃跑導致鎮(zhèn)武堡、閭陽堡的明軍也被打敗，明盤山參將、明甘肅總兵在沙嶺戰(zhàn)死！明靖東營中軍游擊逃往覺華島，西平堡守軍等地援軍跟明西平堡參將黑云鶴，也戰(zhàn)死！

當時明遼東經(jīng)略已離開廣寧右屯衛(wèi)去駐軍閭陽堡了，此刻明山東布政司左參議邢慎言，就勸他急救廣寧衛(wèi)卻被明寧遠衛(wèi)指揮僉事韓初命，給阻撓住他認為現(xiàn)在回去就是送死？

于是明遼東經(jīng)略就撤回來，而后金軍卻在沙嶺停了下來不敢向前走害怕有伏兵？就讓明遼東巡撫的心腹愛將早已偷偷投降后金的孫得功，去活捉明遼東巡撫獻功，機智的他在城內(nèi)對軍民們謊稱后金軍已到城下，嚇得城內(nèi)軍民們各自逃跑。

明廣寧衛(wèi)左參政高邦佐，阻擋不住軍民就跑去廣寧衛(wèi)指揮所里找王巡撫，然而明遼東巡撫正關門處理軍務毫不知情？明振武營參將江朝棟，推門而入時還被明遼東巡撫大聲訓斥，只見明振武營參將直接喊道“王巡撫大人不好了！東虜殺入城了，事情危險請速撤離！”

不知所措的明遼東巡撫被扶上馬逃走，來到大凌河時遇到了明遼東經(jīng)略被嘲笑道“王巡撫大人好厲害啊？6萬軍隊就可以把敵人一舉殲滅現(xiàn)在怎樣呢？”感到慚愧的明遼東巡撫就建議駐守寧遠衛(wèi)和廣寧前屯衛(wèi)。

但明遼東經(jīng)略卻說道“已經(jīng)晚了！現(xiàn)在只有保護百姓撤入山海衛(wèi)去。”說完就把5千士兵交給明遼東巡撫殿后，并把部積蓄燒了撤軍，由明遼東經(jīng)略和明寧遠衛(wèi)指揮僉事一起護送難民入關。

隨后明遼東巡撫王化貞、明遼東監(jiān)軍道高出、明兵科給事中胡嘉棟，等將領也先后入關，只有明寧遠衛(wèi)左參政高邦佐，一人無言以對拔刀自殺！后金入城時孫得功率領廣寧衛(wèi)明軍投降被納入（鑲白旗）當中軍游擊。

此刻后金天命汗愛新覺羅·努爾哈赤，搶掠廣寧衛(wèi)、廣寧中衛(wèi)、廣寧左衛(wèi)、廣寧右衛(wèi)、廣寧前衛(wèi)、廣寧后衛(wèi)、廣寧后屯衛(wèi)、廣寧中屯衛(wèi)、廣寧左屯衛(wèi)、廣寧右屯衛(wèi)、廣寧中左守御千戶所。

并接連入侵漠南蒙古哈喇慎部占領明軍放棄的義州衛(wèi)、平陽橋、西興堡、鐵場堡、小凌河、錦安堡、團山堡、鎮(zhèn)寧堡、鎮(zhèn)