與此同時，他在全省刊發告示。內言國家與外國訂立條約，允許洋人設立教堂傳教，承認有保護教堂之責。平民遇有冤屈之事，只可向長官呈訴申理，切勿私自報復，倘若聚眾哄鬧，私相尋仇，不僅使國家受到連累損失，自己也違背王法，有理變成無理。

遇有民教涉訟，傳教士應當遵守中國法度，不得干預地方官審理案件。教民信教，仍是中國之人，必須遵守本國法令，倘若持教為非作歹，定要依法治罪，決不寛貸。

同時通飭各級官員，遇有訴訟案件，不分民教，但論曲直，持平辦理。如有洋人和傳教士干預，應當根據條約章程分別駁斥，不得偏聽袒護。如果傳教士不安本分，稟請上司核辦。差役勒索，盡法懲治。

緊接著，刊發中外條約章程，令官員講習，教育民眾，保護教堂。一切攤派，平民有的，教民也不例外。

十九日，袁世凱又將勸民教告示稿和通飭各級官員稿，連同濟南、東昌、泰安和臨清發生的一百四十六起教案案情咨呈總理衙門，讓他們了解山東義和團的實際情況。

慈禧太后粉碎戊戌變法重新訓政后，就想廢掉光緒，另立新君。她對被她扶上大位的“兒子”竟然想要害她傷心到了極點。

因外遭各國譴責，內受二江總督等封疆大吏的強烈反對而作罷。

但她一直沒死心，到了一九九年的十月，她認為其訓政的地位已經很鞏固，決定于元旦廢掉光緒，立端郡王載漪之子溥儁為帝，改元普慶。

軍機首輔榮祿怕擔惡名，獻計把溥儁暫時先放到大阿哥的位置，做為緩沖，也可以試探一下各方面的反應。

慈禧太后覺得這個辦法也不錯，就在一九零零年一月二十四日，她召集親王、貝勒及各大臣，命光緒宣讀了立溥儁為大阿哥的上諭。

明確溥儁將來是繼承同治大統，預立皇儲。

史書稱此為“乙亥建儲”。

本來慈禧再出訓政就反對聲不斷。

這樣的建儲等于是廢掉了光緒，違背清朝的祖制，立刻遭到了國內外的一致反對。

袁世凱覺得這是他在慈禧太后表現的機會，馬上上折慈禧太后“恭賀圣喜”，上折光緒“恭賀天喜”。果然很討慈禧喜歡，但光緒則對其恨得更甚。

顯然，袁世凱上呈總理衙門的資料有了收效。

二月十九日，朝廷根據總理衙門的上奏，發布諭旨，嚴行禁止義和團，秉公處理教案。

對照上一個上諭，這使袁世凱感覺到了，朝廷內部對義和團有二種態度，而最高決策者在左右搖擺。

袁世凱認為必須要抓住這有利時機，立即命人擬定《嚴禁拳匪暫行章程》，和上諭一起張貼出去，廣而告之。

章程完全是按袁世凱的意思起草，內容主要是州縣官吏必須認真訪查緝辦，倘所管所轄境內有設廠教習者，“照縱匪例從嚴查辦”。

莊長、首事、地保必須隨時稟報，徇隱不報，即加監禁，與匪通氣，即加正法。父兄縱聽子弟學習邪拳，除將子弟正法外，父兄監禁三年。

所有拳廠，一律毀平，某家設廠，其家產一律充公。告發某家設廠，將該家家產一半賞給告發之人。拿獲設廠匪首送案者，賞該犯全部家產。

設廠的鄰人如果顧慮拳匪報復，不敢出頭告發，應即通知莊長、首事、地保，密報到官，以憑拿辦。知而不報者，提案嚴辦，窩留者與匪同罪。

從前拳匪，除著名匪首及曾犯焚搶重罪者仍應查拿外，其余被脅者但能悔過自新，一概從寛免究。倘有挾仇誣告，希圖分賞者，即行反坐科罪，決不寬貸。

袁世凱一方面命令各級官員和紳士分赴四鄉，挨戶傳諭，每天報告義和團的蹤跡。

一邊派出武衛右軍全力追剿，在全省范圍內掀起了一個剿滅義和團的。