一直到民國四年五月三十一日，袁世凱才明確王士珍代理陸軍總長，并發(fā)表明令給段祺瑞。放其病假兩月，支人參四兩，醫(yī)藥費(fèi)五千元。

命令如下：

“前據(jù)陸軍總長段祺瑞呈稱：自去冬患病，飲食頓減，夜不成寐，迄至今春，遂致咯血，多方診治，時(shí)輕時(shí)重。醫(yī)言血虧氣郁，脾弱肺熱，亟當(dāng)靜養(yǎng)，服藥方能有效，迄今四月有余，方值國家多故，未敢言病。

“現(xiàn)大局稍就平定，擬請開去差缺，俾得安心調(diào)理，冀獲速痊等情。當(dāng)傳諭少給假期調(diào)養(yǎng)。茲據(jù)續(xù)請開去各項(xiàng)差缺，俾得安心調(diào)養(yǎng)，庶獲就痊。

“查自辛亥改革以來，該總長勛勞卓著，艱險(xiǎn)備嘗。民國初建，憂患迭乘，數(shù)年經(jīng)營，多資臂助，因而積勤致血衰氣弱，形容羸削，迭于會(huì)議之時(shí)面諭該總長酌于一星期抽兩三日赴西山等處清靜地方調(diào)養(yǎng)休息，以期氣體復(fù)強(qiáng)，而該總長以國事為重，仍不肯稍就暇逸，盡瘁國事，殊堪嘉敬。

“茲據(jù)呈請開缺，情詞肫摯，本大總統(tǒng)為國家愛惜人才，未便聽其過勞，致增病勢，特著給假兩個(gè)月，并頒給人參四兩，醫(yī)藥費(fèi)五千元，以資攝衛(wèi)。該總長務(wù)以時(shí)局多艱為念，善自珍重，并慎延名醫(yī)，詳察病源，多方施治，切望早日就痊，立即銷假。其在假期內(nèi)如有軍務(wù)重要事件，仍著隨時(shí)入內(nèi)會(huì)議，以抒嘉謨而裨國計(jì)。此令！”

段祺瑞正式解除陸軍總長職務(wù)是這年的八月二十九日，與這命令同時(shí)公布的，是正式由王士珍接任陸軍總長的職務(wù)。

段祺瑞離職后不久，袁世凱便指使肅政廳彈劾徐樹錚**外軍火浮報(bào)四十萬元，免去他陸軍次長職，以田中玉繼任。

袁世凱與段段祺瑞之間，由于段的病假，袁的明令給假種種而惹起許多流言。爭傳二人已正式?jīng)Q裂，而很多跡象也表明此非無穴來風(fēng)，兩個(gè)人之間的問題早已擺在了明處。袁世凱越做作，越啟人疑竇。北洋將領(lǐng)之間未嘗沒有矛盾糾葛，但兔死狐悲，尤其是徐樹錚的被處罰，段祺瑞派系中人更是人人自危。

此地?zé)o銀，八月三日段祺瑞發(fā)表通電辟謠：

“廿年前大總統(tǒng)在小站練兵時(shí)，祺瑞以一武備學(xué)生充下級(jí)武秩，與大總統(tǒng)素?zé)o關(guān)系，乃承采及虛聲，立委為炮隊(duì)統(tǒng)帶，升任統(tǒng)制，不數(shù)年由千總微秩，擢道員、總兵、副都統(tǒng)各職。及大總統(tǒng)東山再起，祺瑞復(fù)見任湖廣總督、六軍總長各職，以大總統(tǒng)知祺瑞之深，信祺瑞之堅(jiān)，遇祺瑞之厚，殆無可加。

“是以感恩知己，數(shù)十年如一目，分雖部下，情逾骨肉。近數(shù)年來，祺瑞因吐血失眠，吁懇息肩，乃包藏禍心之某國報(bào)紙，以挑撥離間之詭計(jì)，直欲誣祺瑞為忘恩負(fù)義之徒，甚至偽造被人行刺之謠，更屬毫無影響，不得不略表心跡以息訛言。”

很多時(shí)候，官場是謠言越辟越真。段祺瑞所謂行刺及某國報(bào)紙，原來是這樣的：陸軍部曾發(fā)生茶役偷置**案，日本報(bào)紙有意挑撥，說這是袁世凱欲謀殺段祺瑞的政治陰謀。

北洋軍人都認(rèn)為，袁世凱和段祺瑞分家的導(dǎo)火線，是袁克定編練“模范團(tuán)”觸發(fā)的。

袁世凱自小站練兵起，歷來把軍權(quán)死死抓在手里。不過自他當(dāng)總統(tǒng)后，已經(jīng)有心而無力。久而久之，袁世凱覺得自己對北洋軍已經(jīng)失去控制。

加之常有人在他耳邊吹風(fēng)，說北洋軍的方方面面已經(jīng)過時(shí)，中國急需締造一支新型的軍隊(duì)，就像袁世凱當(dāng)年在小站練兵一樣，所謂從頭再來。

開始，袁世凱沒怎么動(dòng)心思，但三人成虎，時(shí)間久說得多了，袁世凱便不能不重視了。

在大元帥統(tǒng)率辦事處未成立時(shí)，袁克定便經(jīng)常和德國的丁克滿少校，法國的白禮蘇中校討論軍事學(xué)和訓(xùn)練新軍的問題。

為了建立起一支更新的新軍，袁克定向袁世凱建議，在統(tǒng)率辦事處下面成立一個(gè)模范軍。由大元帥兼模范軍軍長，這個(gè)計(jì)劃和清