七月十四日，黎元洪下令懲治帝制禍首“自變更國體之議起，全國擾攘，幾陷淪亡。始禍諸人，實尸其咎。楊度、孫毓筠、顧鰲、梁士詒、夏壽田、朱啟鈐、周自齊、薛大可均拿交法庭，詳確訊鞠，……余悉從寬免。”

護國軍方面提出的懲治帝制禍首是十三人，即所謂的“六君子”和“七兇”，合稱十三太保。經各方討價還價，黎元洪中間調和，最后定為以上八人。

此前的六月十日，黎元洪已下令撤銷了袁世凱搞的那個陸海軍大元帥統帥辦事處。加上恢復舊《約法》和國會及懲治帝制禍首，這也被稱做黎元洪上任大總統三把火，大得人心。

恢復舊了《約法》和國會，懲治了帝制禍首，護國的目標已基本達成。不久，唐繼堯、岑春煊、梁啟超、劉顯世、陸榮廷、陳炳焜、呂公望、蔡鍔、李烈鈞、戴戡、劉存厚、羅佩金、李鼎新等聯合通電撤銷西南軍務院，聲明國家一切政務，靜聽元首、政府和國會主持。

國內矛盾緩和，南北也初步達成了統一，人們對國家的前途滿懷期待。

黎元洪和段祺瑞，一個是總統，一個是國務總理，這兩個人的組合真的很不錯。前面說過，當時的中國，最有實力的軍事集團是北洋軍，雖然，袁世凱死后，北洋系有些群龍無首，但段祺瑞基本上還是能夠掌控的。而黎元洪在當時，即使沒有能力把各方完全的凝聚起來，但還是能在很大的程度上協調各方面關系的。

這兩個人，個人品質都不錯，也都有治國理政的能力。

歷史給了這飽經苦難的國家以機會，假如黎元洪和段祺瑞能夠精誠合作，假如總統和國務總理能夠形成合力，只可惜這兩個人根本搞不到一起。

有人說，在袁世凱時期，內閣的責任制一直是可望而不可及的。像袁世凱那樣的死死地把什么權力都抓在手中的總統，內閣的責任制當然無法實現。到了黎元洪當總統，段祺瑞為國務總理時，內閣的責任制是真的實現了，只是過了頭。

段祺瑞這個總理和總統黎元洪的關系不睦，既有近因也有遠因。

前面說過了，黎元洪當了副總統后，袁世凱一直想把黎元洪從湖北老窩挖出來，幾次不能得逞后，直接派人去逼請。黎元洪一上火車，就直接由逼走黎元洪的人，把湖北都督的位置占上，我們知道，這個人就是段祺瑞。

段祺瑞署理湖北的時間雖只有幾個月，但他干了件事，把湖北的軍隊裁撤了，用北洋軍取而代之。這其實是把黎元洪的老窩給端了，黎元洪對此能不心存芥蒂嗎？

兩個人合不來的一個重要因素，是段祺瑞壓根就沒看得起黎元洪。軍人是講官階的，民國前兩個人的官職固然是其中的原因，但還有更重要的。

黎元洪的床下都督的說法雖是謠傳，但已經是真假難辨并廣為流傳，別人信不信不知道，反正段祺瑞是深信不疑。平白無故撿個大都督當就是了，這一不留神又撿個大總統當，段祺瑞能服氣嗎？

如果段祺瑞是個善于掩飾的人，是個心口不一的人就好了，但是，段祺瑞又正好是個真性情之人，有什么心事，一定要表現出來。

黎元洪脾氣是不錯，但畢竟是大總統，所謂狗尿苔不濟，長在了金鑾殿上，這最高領導的面子總是要要的。段祺瑞的鄙視，讓黎元洪如何受得了？

在段祺瑞看來，我給你黎元洪個總統當，你撿了個大便宜，就好好當個橡皮圖章就是了。撿了便宜就不要賣乖，什么事都不要管，免得添亂。

如果黎元洪是個只想當官不想管事的人，那就好了。可惜他不是，而是個責任心特別強的人，是個在其位必謀其政之人。

一開始還可以，黎元洪在裁撤陸海軍大元帥統率辦事處時，因為這是袁以總統的身份抓軍權的機構，袁在世之日和段鬧得最不愉快的，就是這個機構。黎當總統，段肯