七月二日晚九時，段祺瑞偕同梁啟超等馳抵馬廠。

馬廠在天津以南。相傳明開國皇帝朱元璋騎兵部隊南征得勝，班師休整途中見該地草肥水甜，氣候宜人，遂養兵憩馬于此。人們見馬多而稱之為“馬場”，后演變為“馬廠”。

當晚段祺瑞分別和各將領密談，進行說服和協調工作。

七月三日上午八時，第八師司令部舉行組織討逆軍軍事會議。會議公舉段祺瑞為討逆軍總司令，慷慨誓師。段隨后組織了司令部，派段芝貴為西路討逆軍總司令，以梁啟超、湯化龍、徐樹錚、李長泰為討逆軍總部參贊，靳云鵬為總參議。

段祺瑞在財政上除了日本支援以外，梁士詒的舊交通系也予以支持，曾在交通銀行預借軍餉二百萬元。

民國六年七月四日，段祺瑞以討逆軍總司令名義發出討伐張勛的通電

“天禍中國，變亂相尋，張勛懷抱野心，假調停時局為名，阻兵京國，至七月一日，遂有推翻國體之奇變。竊惟國體者，國之所以與立也，定之匪易。既定后而復圖變置，其害之于國家者，實不可勝言。且以今日民智日開，民權日昌之世，而欲以一姓威嚴，馴伏億兆，尤為事理所萬不能致。

“民國肇建，前清明察世界大勢，推誠遜讓，民懷舊德，優待條件，勒為成憲，使永避政治上之怨府，而長保名義上之尊榮，宗廟享之，子孫保之。歷考有史以來二十余姓帝王之結局，其安善未有能逮前清者也。今張勛等以個人權利欲望之私，悍然犯大不韙，以倡此逆謀，思欲效法莽、卓，挾幼主以制天下，竟捏黎元洪奏稱改建共和，諸多弊害，懇復御大統，以拯生靈等語，擅發偽諭。橫逆至此，中外震駭。

“若曰為國家耶，安有君主專制之政，而尚能生存于今之世者？其必釀成四海鼎沸，蓋可斷言。而各友邦之承認民國，于茲五年，今覆雨翻云，我國人雖不惜以國為戲，在友邦則豈能與吾同戲者。內部紛爭之結局，勢非召外人干涉不止，國運真從茲斬矣。若曰為清室耶，清帝沖齡高拱，絕無利天下之心，其保傅大臣，方日以居高履危為大戒，今茲之舉，出于迫脅，天下共聞，歷考史乘，自古安有不亡之朝代？

“前清得以優待終古，既為曠古所無，豈可更置諸嚴墻，使其為再度之傾覆以至于盡？祺瑞罷斥以來，本不敢復與聞國事，惟念辛亥締造伊始，祺瑞不敏，實從領軍諸君子后，共促其成。既已服勞于民國，不能坐視民國之顛覆分裂，而不一援。且亦曾受恩于前朝，更不忍聽前朝為匪人所利用，以陷于自滅。情義所在，守死不渝。諸公皆國之干城，各膺重寄，際茲奇變，義憤當同。為國家計，自必矢有死無貳之誠，為清室計，當久明愛人以德之義。復望戮力同心，戢茲大難，祺瑞雖衰，亦當執鞭以從其后也。敢布腹心，伏維鑒察。”

同日討逆軍總司令段祺瑞發表“討逆檄文”，全文如下

“討逆軍總司令段祺瑞，謹痛哭流涕申大義于天下曰嗚呼，天降鞠兇，國生奇變。逆賊張勛，以兇狡之資，乘時盜柄，竟有本月一日之事，顛覆國命，震擾京師，天宇晦霾，神人同憤。該逆出身灶養，行穢性頑，便佞希榮，漸躋顯位。自入民國，阻兵要津，顯抗國定之服章，焚索法外之餉糈，軍焰兇橫，行旅裹足，誅求無饜，私橐充盈，凡茲稔惡，天下共聞，值時多艱，久稽顯戮。

“比以世變洊迫，政局小紛，陽托調停之名，明為篡竊之備，要挾總統，明令敦召，遂率其丑類，直犯京師。自其啟行伊始，及駐京以來，屢次馳電宣言，猶以擁護共和為口實。逮國會既散，各軍既退，忽背信誓，橫造逆謀。據其所發表文件，一切托以上諭，一若出自幼主之本懷，再三臚舉奏折，一若由于群情之擁戴，夷考事實，悉屬愆當日是夜十二時，該逆張勛，忽集其兇黨，勒召都中軍警長官二十余人，列戟會議，勛叱咤命令