廣州軍政府雖然恢復了，實際上勢力僅及廣東一省。

這期間，孫中山的處境是很艱難的。在南北戰(zhàn)爭其間，列強駐中國的外交團曾和中國的南北政府訂有協(xié)定，將各省關稅余款百分之十三交付軍政府。當孫此番再接收軍政府后，外交團提出軍政府權力只及廣東一省，不能代表西南，停止這筆撥款。

軍政府外交部長伍廷芳曾屢次向駐粵領事團提出抗議，最后一次聲稱如果不履行協(xié)定，軍政府將接收海關以資報復。列強并不買帳，出動了大批炮艦駛白鵝潭示威。

看到北京方面有徐世昌這個總統(tǒng)，比廣州政府在國際上各方面都叫得響，孫中山認為南方也必須成立一個名正言順的政府。

前邊提到過，很長時間了，孫中山就想有把廣州的軍政府正式化，正式之途徑就是選舉總統(tǒng)，改變四不像的總裁制。

只是，這個計劃一開始就遭到西南各省的反對。理由是西南各省已樹自治旗幟，“護法”二字已經不足以號召，何況舊國會議員在廣東的，僅二百余人，也距離選舉總統(tǒng)的法定人數甚遠。

廣東的實力派人士陳炯明，內心是傾向聯(lián)省自治的，只是不便公開提出反對意見。而陳炯明部下葉舉、洪兆麟等人則反應強烈，公開反對選舉總統(tǒng)，甚至以軍隊不穩(wěn)相要挾。

將桂系趕出廣東后，孫中山極力主張乘勝追擊奪取廣西，把桂系從西南清除。選舉總統(tǒng)不成孫中山退而求其次，打算在主席總裁的名義上加一個“大元帥”頭銜，由他自己帶兵去打廣西。對此，陳炯明同樣不贊成，他的意見是應首先鞏固廣東省自治，再徐圖團結西南，共抗直系。

孫中山曾和陳炯明懇切密談，勸陳認清環(huán)境，眼光放遠，以一個人作比喻，如果心肝五臟都已潰爛，則四肢怎會完好？一個國家如果糜爛，廣東一隅豈能保全？至于保境則需依賴軍隊，養(yǎng)兵以保境則財困民疲，所謂息民豈不是空談。息民做不到更遑論建設？不能建設，廣東一省如何進步？不能進步則是固步自封。所以今天大家應該把眼光放遠。從大處著想，皮之不存，毛將焉附！

對于孫中山，陳炯明有他的看法，如他對唐繼堯所說“中山只是一個大炮”。有了這樣的觀念，孫縱有再多的金玉良言陳也很難聽得進去。

孫中山對陳炯明不合作不聽命的態(tài)度，非常忿怒，忍無可忍，打算削減其軍權，或是免除其省長兼職，使其不能繼續(xù)掌握財權（當時財權在財政廳，受省長管轄，財政總長則有職而無權）。或者解除其陸軍總長兼職而以唐繼堯繼任，但汪兆銘等勸孫中山投鼠忌器，怕鬧得下不了臺反而撕破了臉。

孫中山在一九二一年元旦慶典上，在對軍政府同仁訓話時，表示護法不能解決問題，希望國會在廣東組織政府，對國際間明白昭示，必需北伐以統(tǒng)一中國。因為北京政府既不合法，又不孚民望。

孫的主張傳出后，海外華僑、社會賢達、國民黨支部都紛紛電請孫，從速組織選舉總統(tǒng)。

這時，北京政府在國際間強調南方已沒有軍政府，全國已經統(tǒng)一，因此向四國銀行團洽商大借款。

孫中山認為時機迫切，亟應把握時間，免得國際間真的進一步和北京政府連成一氣，北伐大業(yè)就更加困難。便于一九二一年四月四日，宴請在廣州的國會議員，正式要求國會從速選舉總統(tǒng)，如果國會不肯同意，他就一走了之。

前邊也提到過，對于選舉總統(tǒng)，唐繼堯在云南時是不贊成的，到了廣東后由反對派變成了贊成派。于是七位總裁中，現在已有四位總裁站在同一陣線上，孫的選舉總統(tǒng)主張就很容易實現了。

四月七日在廣州的國會非常會議參眾兩院聯(lián)合舉行會議，議員出席二百二十余人，由參議院議長林森主持，首先通過了高鎮(zhèn)圭提出的改開非常會議的動議。在非常會議中，討論周震麟所提的“中華民