重論述了有關哲學“認識之概念、主觀之認識、實現世界之認識、本體世界之認識、認識之程度”等幾個問題。

蔡元培說“哲學之認識同倫理之認識，對于真理或非真理所作正確之判斷是也。認識分之為主觀之認識、實現世界之認識、本體世界之認識，為其對象不同而性質亦有不同也。奉體論論述了何為本體論及世界之實在及性質幾個問題?！?

他對唯物論、實質唯識論、二元論一元論部分則分別作了說明。

關于世界“全體之實在及性質，則又舉無神論、泛神論及有神論”三者予以闡明。

價值篇一編，他說“價值即意識懸一種之鵠的而欲有以達之。后則分道德、宗教思想、美學觀念敘述之”。

關于哲學方面，蔡元培還有《怎樣研究哲學》、《哲學要領》、《妖怪學講義》等一系列的文章和著作。

他所以如此重視哲學問題，是因為在他看來，宋代以后，中國的哲學便趨于僵化了，到了清代，幾乎無哲學思辨可言。這種學術狀況，是導致近代中國全面落后的要因之一。欲救此弊，便應當大力學習西方先進的學術成果，創造中西合璧的新文化。因此，大力向國人介紹西洋的哲學就成為當務之急。

1915年春，日本向中國提出的“二十一條”披露于報端，留法學界聞悉群情激憤，汪精衛、李石曾、譚熙鴻等紛紛來到蔡元培的住處，共商對策。蔡元培依據大家議論的意見，草擬《華人御侮會會章》七條。

所擬條文倒是簡明扼要，其主要內容為

（一）、本會以憑籍己力（不倚賴政府，不倚賴軍隊）、濟度同胞、排除外侮為宗旨。

（二）、本會會員應盡之普通責任1、鍛煉體魄；2、了解并自備適當之武器，如匕首、炸彈、手槍、毒物等；3、養成抑強扶弱之習慣；4、力持可殺不可辱之氣節；5、見敵人侮我同胞者擊之，事變如有株連，則挺身任之；6、不購敵人貨物（書報及武器例外），7、不乘敵人船舶；8、不與敵人之銀行交易，亦不用其鈔票；9、不租屋給敵人；10、不售地產給敵人；11、不服役于敵人；12、華人有犯，竭力勸止之；13、有華人助敵而侮我同胞者，誅之。

（三）、本會會員得量力以盡之特別責任1、入敵境而偵探之；2、入敵境而以相當之手段破壞敵侮我之陰謀及武器。

（四）、本會勸導同胞之種種設備1、印刷品；2、公開或秘密的演講會。

（五）、本會為會員盡責各種便利條件，如采運廉價貨物，增設交通機關；收購地產，介紹職業；制備各種武器等。

此外還有與各國革命黨聯絡之類。

在章程提出討論時，蔡元培還是想有所動作的，他說“日本竟下辣手，雖以我等之奄奄如陳死人者，亦大為之刺激，以為不可不采一種急進之方法，以為防御?！?

汪精衛提出，此會本屬秘密性質，不必用會名，也無須會章，“但言抵抗強權之辦法亦可”，得到大家的同意。

對于是否應立即付諸行動，李石曾“仍持先籌萬國革命之說，又頗謂日本之事，似尚有從容對付之余地，不可過于張皇云云”。

汪精衛則認為，“萬國革命，緩不濟急，目前只能持抵抗日本之惟一主義”，并打算先到南洋后根據局勢發展再定或急或緩的應對辦法。所謂“急”法，就是“歸國效死”。所謂“緩”法，則是“籌款以設機關”。譚熙鴻提出，如果是設機關，最好是設立學校，“行精神教育”。

雖然，最終華人御侮會只停留在口頭上，但在民族主義進一步覺醒的時代，這反映了蔡元培等中華民族先進分子較為清醒的、自主的愛國意識，自覺、自動的起來承擔國民責任的可貴精神。他們的行動，是近代中華民族在捍衛民族生存、喚醒民族意識的長期奮斗過程中一個